当车辆因自然灾害造成损失时，赔偿流程通常如下：
1. 报案：尽快向保险公司报案，并提供相关证明文件，如车辆保险单、行驶证、驾驶证等。同时，需要提供灾害证明，如气象部门发布的相关证明文件。
2. 现场勘查：保险公司会安排工作人员进行现场勘查，对车辆损失情况进行评估。
3. 提交理赔资料：根据保险公司的要求，提交相关的理赔资料，如车辆维修发票、车辆损失鉴定报告等。
4. 审核理赔：保险公司会对提交的理赔资料进行审核，并确定赔偿金额。
5. 赔偿支付：一旦理赔审核通过，保险公司会将赔偿款项支付到车主的账户中。
需要注意的是，不同的保险公司和不同的保险产品可能有不同的赔偿流程和要求，因此车主需要仔细查看自己的保险条款和细则，以便在遭遇灾害时能够及时、准确地处理车辆损失问题。此外，车主还应该注意保留好相关证据和文件，以便在需要时提供证明。
最后提醒一下，如果车主对保险公司的赔偿决定存在异议，可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决争议。