股票清仓后自动止损智能条件单仍然被触发执行的原因可能有以下几种可能性：
1. 系统延迟或操作失误：可能是由于系统处理延迟或操作失误导致止损单在股票已经清仓后仍然被触发。在这种情况下，建议联系交易平台或券商客服部门，确认交易状态并了解具体情况。
2. 止损条件设置问题：如果设置的自动止损条件是在某个价格水平下触发，那么在股票价格达到该水平时，无论是否已清仓，止损单都会被触发。因此，请检查设置的止损条件是否准确。
3. 持仓状态理解问题：有时候可能存在误解，以为自己已经清仓了但实际上仍有部分持仓。在这种情况下，任何触及止损点的价格波动都会触发自动止损单。因此，务必确认自己的持仓状态。
为了避免不必要的损失和风险，建议在遇到这种情况时及时联系交易平台或券商的客服部门，了解具体情况并寻求解决方案。此外，务必保持对自动止损智能条件单设置的关注，确保其符合自己的投资策略和风险承受能力。